Når fysioterapeuten har undersøgt dig, vil han eller hun sammen med dig indlede den behandling, der bedst muligt vil kunne føre dig frem til dit mål. Som regel vil behandlingen være en kombination af mange ting, og den vil altid involvere dig selv, så du lærer at forebygge nye tilfælde. Behandlingen kan fx bestå af:

Råd og vejledning
Øvelsesterapi
Fysioterapeuten vil ofte få dig til at lave specifikke øvelser for at træne svage muskler op, eller for at selvmobilisere stive led. Det kan fx være øvelser for mave- og rygmusklerne, hvis du har dårlig ryg, eller det kan være en øvelse i at få bestemte muskler til at spænde af. Øvelserne udføres sammen med fysioterapeuten, og du vil som regel blive instrueret i nogle øvelser, du skal lave derhjemme. 

Ledmobilisering/manipulation
Et led kan låse eller ledfladerne kan have svært ved at glide mod hinanden. I sådanne tilfælde kan fysioterapeuten benytte særlige manipulationsteknikker til at frigøre leddet.

Apparatbehandling
Apparatbehandling kan bestå af ultralyd, kortbølge, laser, TNS eller andet, hvor man inddrager elektriske apparater, for at give en ønsket reaktion i vævet - fx en øget blodgennemstrømning lige præcis der, hvor man ønsker det. Mange af apparaterne har også smertelindrende effekt.

Udspænding
Ofte viser det sig, når fysioterapeuten undersøger en patient, at en eller flere muskler er for stramme og derved skaber ubalance, så led og muskler m.v. overbelastes. I de tilfælde vil fysioterapeuten manuelt lave udspænding af musklen og samtidig instruere dig i, hvordan du selv kan udspænde.